- Trong hệ điều hành Linux, những tập tin mà người sử dụng nhìn thấy được đều theo cấu trúc cây thư mục, với root nằm ở trên cùng. Từ điểm này các thư mục và tập tin mới mọc nhánh ra lan dần xuống phía dưới.
- Hệ điều hành Linux hình thành từ nhiều thư mục và tập tin khác nhau. Nhìn chung, đa phần hệ điều hành nằm ở hai file system: root file system (file system gốc) được ký hiệu là /, và một file system khác được kết nối theo /usr (đọc là user).

|
Thư mục quan trọng (lỗi ảnh hưởng hệ thống)
|
Thư mục ít quan trọng (lỗi không ảnh hưởng hệ thống)
|
|
/ – thư mục gốc, chứa toàn bộ hệ thống
|
/home – dữ liệu cá nhân người dùng
|
|
/bin – lệnh cơ bản (ls, cp, mv…)
|
/tmp – file tạm thời
|
|
/sbin – lệnh quản trị hệ thống
|
/var/log – log hệ thống và ứng dụng
|
|
/etc – file cấu hình hệ thống
|
/media – mount thiết bị di động (USB, CD)
|
|
/lib – thư viện cho chương trình
|
/mnt – mount thiết bị lưu trữ tạm thời
|
|
/boot – file khởi động (kernel, GRUB)
|
/opt – ứng dụng cài thêm
|
|
/dev – file thiết bị
|
/srv – dữ liệu dịch vụ mạng (web, FTP)
|
|
/proc – thông tin tiến trình và kernel
|
/root – thư mục home của user root
|
|
/usr – ứng dụng, thư viện, tài liệu
|
|
|